正畸治療雖然患者成分較為單純，但是也不能例外，要嚴格的防止交叉感染。在正畸治療中，首先要對患者進行分別處理，對於一些明確帶有乙肝抗原或其他傳染性疾病的患者，需要設立單獨的接診位置，使用的器械單獨處理。其次，在治療過程中使用一次性的口腔器械盤，對於無法一次性使用的器械,需要進行嚴格的消毒，包括高溫高壓消毒、化學藥劑浸泡、紫外線照射等多種方式，根據器械的種類和特性選擇使用。正畸醫師在治療的過程中，必須佩帶口罩、帽子和一次性手套，看完一位患者後，要及時的洗手和更換手套。正畸診室和牙科綜合治療椅這類大型設備,每日做固定時間的紫外線照射來殺滅病菌，達到消毒防止交叉感染的目的。

       若有牙周病必須格外的謹慎，而且必須符合一定的前提條件。第一,牙周病必須已經得到控制，穩定至少半年以上，處於牙周病變的靜止期才可以考慮接受正畸治療。第二，牙周的狀況必須在可接受的範圍內，牙槽骨的吸收量不能超過牙根長度的1/2,更不能有正在發生的進行性吸收，牙齒不能有明顯的鬆動，牙齦狀況良好，沒有過度的增生和炎症。如果，患者的條件符合上述前提，則可以考慮進行正畸治療，但是在治療的過程中，還是要密切監控牙周狀況，嚴格控制口腔衛生，隨時聽取牙周醫師的建議。總之，牙周病患者可以接受正畸治療，但是需要承擔的風險要比普通的患者大得多。

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